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BIOVIA Discovery Studio 药物设计软件平台

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Biovia
DS 2022
高教
详细说明

BIOVIA Discovery Studio 药物设计软件平台

可靠的科研软件包

多目标优化的药物研发。研究者在优化生物化学的有效性进的同时还须对诸如ADME及毒性等其他性质进行优化。软件开发建立在BIOVIA Pipeline Pilot及基于多年同行评审研究建立的黄金应用标准(例如,CHARMmMODELERZDockDelphiCatalystDMol3VampTopKatAggMapDevelopability  Index)基础之上,BIOVIA Material Studio为生命科学研究提供了功能全面、量化性、协作性的研究平台。

  BIOVIA Discovery Studio

  BIOVIA Discovery Studio的开发基于BIOVIA PipelinePilot,是功能全面的科学应用软件。软件兼具有开放性、可量化性、协作性,是面向当今生命科学研究需求而开发的独特的研究工具。

  l全面的科研软件包

  ?面向科研需求,为从早期研发至临床前期、生物制药配方开发提供了科学的解决方案

  l成熟的科学原理

  ?拥有30多年的同行评审研究成果为Discovery Studio的科学核心提供支撑

  l协作研究

  ?基于DS Visualizer,Discovery Studio为研发提供了真正全面的可视化及协作框架

  lDiscovery Studio:基于Pipeline Pilot应用

  ?Discovery Studio的每个任务皆基于Pipeline Pilot协议,以确保建模与模拟环境的开放性

  ?可对研究进行自定义及扩展

  ?可扩展架构

  ?可部署的工作流程

  ?为创新提供支持

  ?可与第三方应用集成,包括CCDC GOLD*及伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校的NAMD?

  ?Discovery Studio拥有Pipeline Pilot下述组件的分许可:Core、Integration、Reporting、Chemistry、Sequence Analysis、ADMET

  功能全面的科学预测软件

  l模拟:

  ?基于BIOVIA CHARMm?力场引擎,可为单点能、小化、分子动力学模拟及自由能计算提供的模拟结果

  ?基于从头算DFT量子力学的DMol3、半经验(VAMP)及QM/MM杂化算法(DMol3/CHARMm

  l大分子设计与分析:

  ?市场的同源模型算法MODELER

  ?基于pH值的蛋白质电离工具

  ?基于pH值的蛋白质稳定性及亲和力突变的独特分析

  ?使用ZDOCK对蛋白质-蛋白质对接进行可靠预测

  l抗体研发

  ?功能完善的针对抗体研究的结构预测及模拟工具

  ?成熟自动化结构预测工作流,用于开发寻找抗体的同源模型

  ?AggMap蛋白质聚集及Developability Index

  ?快速鉴定生物药剂蛋白质翻译后修饰(PTM)相关的模体序列

  l基于结构的设计(SBD

  ?基于物理性质(CHARMm CDOCKER)的独特对接引擎

  ?包括对期望的、不期望的及不符合相互作用类型的独有的非键分析检测

  ?基于MMP的独特的活性悬崖检查

  l基于片段的设计(FBD

  ?利用经典药物化学反应进行原位枚举,利用ca.10k从BIOVIA ACD预筛选试剂

  ?使用ca.来自BIOVIA SCD的150万种商用化合物支架跳跃

  ?独特的KarplusMCSS(多拷贝同时搜寻法)片段对接引擎

  l基于药效团及配体的设计:

  ?市场的CATALYST药效团引擎

  ?生成独特的受体-配体药效团

  ?的经过验证的配体分析数据库PharmaDB

  lQSAR、ADMET及TOPKAT预测毒理学

  ?QSAR:可计算物化性质、拓扑指纹性质并生成PLS、GFA、MLR等

  ?全面的ADMET及预测毒理学模型,包括脑血屏障渗透、肝毒性、CYP2D6、AMES、大鼠经口半数致死剂量等

  lX-射线

  ?利用CNX生成电子密度图、图片精修,及利用HT-X PIPE对蛋白质-配体络合物进行自动结构测定


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