可靠的科研软件包 | 多目标优化的药物研发。研究者在优化生物化学的有效性进的同时还须对诸如ADME及毒性等其他性质进行优化。软件开发建立在BIOVIA Pipeline Pilot及基于多年同行评审研究建立的黄金应用标准(例如,CHARMm、MODELER、ZDock、Delphi、Catalyst、DMol3、Vamp、TopKat、AggMap及Developability Index)基础之上,BIOVIA Material Studio为生命科学研究提供了功能全面、量化性、协作性的研究平台。 |
BIOVIA Discovery Studio
BIOVIA Discovery Studio的开发基于BIOVIA PipelinePilot,是功能全面的科学应用软件。软件兼具有开放性、可量化性、协作性,是面向当今生命科学研究需求而开发的独特的研究工具。
l全面的科研软件包
?面向科研需求,为从早期研发至临床前期、生物制药配方开发提供了科学的解决方案
l成熟的科学原理
?拥有30多年的同行评审研究成果为Discovery Studio的科学核心提供支撑
l协作研究
?基于DS Visualizer,Discovery Studio为研发提供了真正全面的可视化及协作框架
lDiscovery Studio:基于Pipeline Pilot应用
?Discovery Studio的每个任务皆基于Pipeline Pilot协议,以确保建模与模拟环境的开放性
?可对研究进行自定义及扩展
?可扩展架构
?可部署的工作流程
?为创新提供支持
?可与第三方应用集成,包括CCDC GOLD*及伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校的NAMD?
?Discovery Studio拥有Pipeline Pilot下述组件的分许可:Core、Integration、Reporting、Chemistry、Sequence Analysis、ADMET
功能全面的科学预测软件
l模拟:
?基于BIOVIA CHARMm?力场引擎,可为单点能、小化、分子动力学模拟及自由能计算提供的模拟结果
?基于从头算DFT量子力学的DMol3、半经验(VAMP)及QM/MM杂化算法(DMol3/CHARMm)
l大分子设计与分析:
?市场的同源模型算法MODELER
?基于pH值的蛋白质电离工具
?基于pH值的蛋白质稳定性及亲和力突变的独特分析
?使用ZDOCK对蛋白质-蛋白质对接进行可靠预测
l抗体研发
?功能完善的针对抗体研究的结构预测及模拟工具
?成熟自动化结构预测工作流,用于开发寻找抗体的同源模型
?的AggMap蛋白质聚集及Developability Index
?快速鉴定生物药剂蛋白质翻译后修饰(PTM)相关的模体序列
l基于结构的设计(SBD)
?基于物理性质(CHARMm CDOCKER)的独特对接引擎
?包括对期望的、不期望的及不符合相互作用类型的独有的非键分析检测
?基于MMP的独特的活性悬崖检查
l基于片段的设计(FBD)
?利用经典药物化学反应进行原位枚举,利用ca.10k从BIOVIA ACD预筛选试剂
?使用ca.来自BIOVIA SCD的150万种商用化合物支架跳跃
?独特的KarplusMCSS(多拷贝同时搜寻法)片段对接引擎
l基于药效团及配体的设计:
?市场的CATALYST药效团引擎
?生成独特的受体-配体药效团
?的经过验证的配体分析数据库PharmaDB
lQSAR、ADMET及TOPKAT预测毒理学
?QSAR:可计算物化性质、拓扑指纹性质并生成PLS、GFA、MLR等
?全面的ADMET及预测毒理学模型,包括脑血屏障渗透、肝毒性、CYP2D6、AMES、大鼠经口半数致死剂量等
lX-射线
?利用CNX生成电子密度图、图片精修,及利用HT-X PIPE对蛋白质-配体络合物进行自动结构测定