BioNumerics很好的满足了研究机构或诊断机构对不同的生物学数据进行分析的要求。这套软件系统已经得到了很多研究机构,包括疾控中心,大学,医院,公共医疗中心,食品,药物和制药企业等各种实验室的广泛认可。
6大应用模块:
· | 指纹图谱类型: |
处理PFGE, AFLP, RFLP, RAPD, REP-PCR, ARDRA, IEF,DGGE, TGGE等电泳数据;气相色谱和HPLC数据;DHPLC数据; 分光光度曲线等数据。 | |
· | Character types: |
处理生物抗性实验数据;脂肪酸甲基化脂(FAME)分析数据;生物显性阵列数据;API表型测试数据;微阵列芯片数据;生化试验数据;酶活和代谢活性数据等。 | |
· | 序列类型: |
处理核酸(DNA或RNA)和氨基酸序列;自动测序仪(Applied Biosystems, Beckman, Amersham)得到的色谱文件;广泛的识别各种序列格式, 包括EMBL, GenBank和Fasta格式。 | |
· | Trend data types: |
处理实时荧光定量 PCR数据;代谢活性和酶活性的动力学数据;微阵列实验中的时间进程数据等和趋势相关的实验数据。 | |
· | 2D 凝胶类型: |
处理双向凝胶电泳试验数据,DIGE试验数据,可将从2-D胶中鉴定到的蛋白点被直接存储在数据库中。 | |
· | 矩阵类型: |
处理DNA同源性相似度的表格数据;DNA杂交数据等矩阵类型数据。 |
7大分析模块:
· | Tree and Network Inference: |
在BioNumerics中通过把关系数据库中的各种记录之间,多种试验之间,用多种有效的聚类算法可以实现多种聚类分析。Bionumerics 6.0 还提供了独特的技术评估聚类分析的可靠性。 | |
· | Identification: 根据生物试验数据结果来鉴定未知的生物体或物种,可构建文库。 |
· | Molecular Analysis Tools: 开放读码框架分析,预测蛋白序列。限制性酶切分析,引物设计等。 |
· | Dimensioning techniques: 多维的数据存储,方差分析等生物学数据统计分析。 |
· | Chromosome Comparison:染色体比对和注释模块。 |
· | Database Sharing Tools:数据库共享工具。 |
· | Audit Trailing and Versioning:适用于GLP实验室 |
商业插件:
· | Heteroduplex Analysis Plugin |
· | BandScoring Plugin |
· | SNP genotyping Plugin |
· | Diversilab Plugin:与BioMerieux(梅里埃)公司DiversiLab基因分型系统进行数据共享并进一步分析 |