河海大学注重优化调整学科布局，整合相关传统学科资源，促进学科交叉融合，构建以水利为特色，工科为主、多学科协调发展的学科生态体系，为推进世界一流大学建设奠定坚实基础。
推动分层分类建设，学科布局显著优化。持续推进学科建设行动计划，注重分层建设、分类指导、重点突破，构建并完善国家级、省级、校级三级学科建设体系。目前，学校拥有42个一级学科，拥有“双一流”建设学科2个、江苏高校优势学科建设工程三期项目立项学科6个，“十四五”江苏省重点学科10个。
强化一流学科引领，学科交叉快速发展。深入推进以“水”为核心的学科交叉与协同创新，充分发挥一流学科辐射带动作用，提高科技创新成果的产出与转化。服务水利行业重大应用需求，设置人工智能交叉学科，开展“人工智能+智慧水利”交叉研究；围绕“碳达峰、碳中和”国家发展战略，设置新能源科学与工程交叉学科，重点研究风能、太阳能、海洋能和综合能源利用等方向关键技术。快速发展的交叉学科，为学校在前沿领域培育新的学科增长点奠定了良好基础。
汇聚学科优势资源，平台建设成效显著。紧密围绕学科前沿和行业需求，重视科研平台建设。成立水科学研究院，以国家重点实验室、国家工程研究中心、国际合作联合实验室等重大平台建设为基础，打造水科学、水工程、水环境及水生态等高质量创新基地，解决行业“卡脖子”问题能力持续提升。
创新学科发展机制，学科活力全面激发。全面落实深化新时代教育评价改革要求，推行“项目制、考核评价、资源配置”三项举措，建设成效不断提升。瞄准重大平台、高层次团队、重大项目等内容，规划形成项目清单，以项目凝聚人才、平台等建设要素，培养一流人才、产出一流成果、主动服务国家需求。构建学科建设成效评价体系，对全校学科进行分层分类考核，重点考核学科影响力、重点工程建设等标志性建设成效。发展机制改革全面激发了学科建设活力，为学校“双一流”建设提供源源不断的内生动力。
