许多技术人员以及真正的使用操作人员容易将水质采样器与水质留样器混淆。的确，在使用过程中有很多的功能两者是可以混用的，不存在严格的界限区分，但从我们厂家的角度来说这个还是比较容易区分的。
采样器主要用来进行主动的水样采取，比较侧重于“采”的过程，因此厂家在研发设计过程中应考虑如何更方便于用户进行移动、携带，毕竟外出水样采集不可能携带体积较大的仪器，只要能满足基本的采样需求即可，当然在易于携带、移动的同时会将更多的功能加装在采样器上面比如恒温冷藏、分瓶采样、水样保护等等，它主要应用于现场水样采集的环保执法、高校科研单位的水样采集化验实验、各类企业的不定期的水样采集检验等等。
留样器主要强调的是“留”的过程，即是将不合格的或者不满足要求的水样进行留存，方便进行水样的再次化验检测。因此留样器的要求相比较采样器的易于移动、携带等特点要高很多，多应用于固定的环境监测板房、环境监测站、企业污废水排放的实时监控等。首先，留样器必须能够实现给在线水质监测仪器（在线COD监测仪、在线氨氮监测仪等）无间断提供水样，即在线监测仪器所需的用来检测的水样是来自留样器提供，因此必须保证留样器24小时*365天全天候处于工作状态；其次，留样器必须能够满足与在线监测仪器进行即时的通讯，可以根据在线仪器发出的信号进行实时的动作，以保证留取水样具有代表性；再次，留样器必须能够实现对水样的全面防护，除恒温冷藏保证留存水样不变质外，还应该设有各种门锁开关等，防止对水样进行非法操作，使水样失去代表性；，留样器还应易于维护，超长时间连续的工作会对仪器自身造成疲劳老化，而更换、维修零部件在所难免，根据监测站对水样实时监控的监控原则，不允许在仪器维护方面耗费大量时间，因此仪器必须易于更换检修等。
总体来讲，采样器与留样器之间还是存在较大差异的，要根据具体的应用场所以及应用需求进行合理的选择，这样既能节省成本又可实现对仪器的利用。
