分子生物学软件SnapGene V5已发布

　　SnapGene是一款强大的多功能的分子生物学工具，能够非常直观的注释分析和DNA图谱，用于创建和共享丰富的注释文件，帮助我们准备清晰的分析生物学绘制相关图形。SnapGene提供了计划，可视化和记录DNA克隆和PCR的极快和简单的方法。您可以轻松注释功能并设计引物。该软件体积小巧，但是功能十分强大，包含了序列编辑、标记、内切酶分析、蛋白产物分子量预等实用功能，可以满足不同生物学研究人员对相应序列进行分析的操作。SnapGene V5已发布！

　　版本5.0的更改

　　新功能

添加了用于DNA和蛋白质序列的成对比对的工具
提供了对自定义背景窗口颜色的支持
添加了以小写形式显示要素翻译的功能
将比对限制在参考DNA序列的指定链或区域中
添加了直接从Ensembl导入序列的功能
启用了一个或多个翻译特征的密码子频率的计算和保存
启用的功能可见性可按功能类型切换
添加了在导入序列迹线以进行重叠群装配或多序列比对时修剪低质量末端的选项
使对齐的cDNA可用于用外显子和内含子注释特征
添加了对打开DNASIS文件的支持
增强的BLAST支持可提供所有五个选项（blastn，blastx，tblastx，blastp和tblatn）
查看参考序列的比对时，更新了“比对序列”菜单，并添加了以下新命令：· 在窗口中复制所选序列·删除所有序列·显示/隐藏序列迹线的质量数据
使多重DNA比对的选定部分可以转换为多重蛋白质比对
添加了一个控件，用于将集合中的选定文件导出为PDF或制表符分隔格式的列表。
添加了一个：“选择DNA序列...”按钮来模拟琼脂糖凝胶对话，作为配置多个通道的捷径
可以将氨基酸序列复制为1或3个字母的氨基酸代码
启用复制成对或多个对齐窗口中跨越多行的选区的功能
添加了新英格兰生物实验室“Tridye?超低范围DNA阶梯”

　　增强功能

计算具有间隙的特征的段的总长度，该信息现在显示在“特征”视图，特征对话框和特征工具提示中
通过使用图标减少了收集界面中“代码编号”列的宽度
添加了通过推出“编辑要素”对话框时调整其阅读框来保留要素翻译的选项
在“首选项”中添加了一个选项，以在道尔顿的蛋白质文件中显示选择的MW
如果在组装重叠群时未包含某些输入序列，则添加了一条通知
添加了用于从列表导入引物的键盘快捷方式
放宽了禁止在引物名称中使用<和>字符的限制
改进了T7启动子功能的检测
改进了从NCBI的导入范围，以允许左端点和右端点交换的区域，并识别“c”表示反向互补
增加了对新遗传密码的支持
改进了与参考DNA序列比对的算法
改进了从geneXplain生成的BED和GTF文件中导入特征的功能
在用户界面中提供了对齐程序（例如MUSCLE）的版本号
通过包括在DNA线以下延伸的线，提高了选择及其端点在地图中的可见性
增强了“编辑MW标记列表”对话框，以支持按供应商显示MW标记，并允许从供应商处一步选择所有的MW标记
在“功能”视图中，具有许多功能的序列极大的改善了滚动性能
在“酶和引物”菜单中添加了命令，以拉出“首选项”中的相应选项卡
蛋白质窗口中的“增强的属性”视图列出了平均分子量和但同位素分子量
使对齐对话框变为无模式，以允许切换到其他SnapGene窗口
通过从选择的每一端向下延伸蓝线，提高了多对齐窗口中共识选择的可见性
进行了广泛的优化，以加快应用程序的总体启动和使用速度
从Webkit切换到QTextEdit以进行富文本控件
改进了对功能限定符和“描述面板”字段中链接的支持
增加了“TA和GC克隆”对话框，以允许通过单击按钮来解决简单问题
改进了用于切换与参考这序列对齐的序列的可见性的控件
改进了用于在显示对齐序列迹线为双链DNA或色谱图之间切换的控件

添加了一条警告，当计算多序列比对时，只有Clustal Omega才能保留内部终止密码

使用“保存到主集合”时，如有必要，可以指定一个主集合
浏览集合时，在“视图”菜单中添加了“列表视图”和“文件夹视图”命令
将“设计综合构造”和“订单构造”命令移至“工具”菜单
合并了所有文件类型（DNA，蛋白质，比对）的默认字体大小设置，并增加了对比对默认字体大小的支持
鼠标悬停在序列迹线中的一个峰上时，改进了使用Opt/Alt查看所有四个碱基高度的可发现性
在“工具”菜单中添加了“管理密码使用表”命令，因为以前只能从“密码使用表”对话框中访问此选项
确保即使在为显示完整说明的情况下，“功能”视图中也可以看到丰富的格式（粗体，斜体，下划线，上标和下标）
在“DNA计算”窗口中添加了“GC含量”值
启用了将凝胶图像，地图和历史记录导出macOS上的EMF矢量格式，以导入到Microsoft Offe产品中的功能
在“功能”菜单中添加了“显示/隐藏所有功能”命令
在“入门”菜单中添加了“显示/隐藏所有入门”命令
确保从NCBI导入时，将LOCUS字段用作默认文件名
增强了逻辑，以便在SnapGene在线数据库导入时，即使不是按字母顺序列出的第一个匹配项，也会自动选择与查询的完美配项

添加了使用Cmd/Alt+单击在多重比对窗口中的共识和比对序列之间转移选择的功能

为“翻转序列”和“设置原点”命令添加了键盘快捷键
增强了蛋白质搜索的灵活性，可以在适当的情况下从查询中剥离终端停止密码子
改进了对复制地图，历史记录和琼脂糖凝胶以及以矢量格式粘贴到macOS上的Microsoft Office的支持
添加了对具有以下功能类型的以下限定符的支持。外显子和内含子：/tran_spicing; misc_recomb：/recombination_class; rep_origin：功能;来源：/metagenome_source;tRNA：operon。
改进了功能限定符/recombination_class，/regulatory_class，/db_xref，/gap_type和/ncRNA_class可用的选项。
添加了“设置翻译编号”的快捷方式
改进了线性图中酶的布局
从NCBI导入并打开GenBank和EMBL文件时，改进了ORF和非功能翻译的遗传密码选择
配置了用于参考DNA序列比对的工具，以便翻转参考序列或重置数字原点将保留比对而不是重新计算它们
使用MilliporeSigma的DNA分子量标记IV和VII时，提高了条带的可见性
添加了新英格兰生物实验室BsaI-HF?V2酶的供应商信息
添加了Thermo Fisher（Invitrogen）Anza?酶的供应商信息
进行了各种文本，颜色和其他视觉增强