南京农业大学以实施本科生创新教育改革为核心，构建“四项结合”创新创业教育模式和创新创业能力训练体系，探索建立农业与生命学科创新创业人才培养路径，走出了一条以“专创融合”为特色的大学生创新创业教育道路。2019年，获评教育部全国创新创业典型经验高校50强。
顶层设计创新双创教育理念。学校成立校院两级大学生创新创业工作领导小组，并成立创新创业学院，多次召开创新创业教育改革专题研讨会，制定《南京农业大学创新创业教育改革实施方案》，确立了“世界眼光、中国情怀、南农品质”的双创人才培养理念，将创新创业教育融入人才培养全过程、融入课堂教学，培养学生的创新精神、创业意识和解决实际问题的能力。基于双创人才培养理念的顶层设计，学校进一步建立“拔尖创新型人才”和“复合应用型人才”的本科生分类培养体系，促进专业教育与双创教育深度融合。
四结合创新双创人才培养模式。围绕“拔尖创新型”和“复合应用型”分类人才培养目标，学校逐步形成 “课内课外、线上线下、校内校外、国内国外”四项结合的创新创业人才培养模式。“课内课外结合”是在第一课堂构建“通识教育+专业教育+拓展教育”双创课程体系，在第二课堂建设“实验、竞赛、成果、实践孵化”双创实践平台，推进专创教育互融；“线上线下结合”是积极构建创新训练智能管理系统、学术科技作品竞赛管理平台等双创智慧教育网络，与线下教育相互补充，为学生提供个性化、开放式的双创学习空间；“校内校外结合”是学校与政府、企业、公益组织广泛合作，共建“新农村发展研究院”“双创实践教学基地”“就业创业实习基地”等基地，帮助学生提升创新创业意识和创新实践能力；“国内国外结合”是学校拓展国际资源，举办“中外农业教育论坛”，为中国农业类高校和农业科技教育参与国际合作创造良好的交流平台。
建立双创能力训练体系。依据学生创新创业实践不同阶段和衔接训练规律，学校搭建了“创新实验平台、双创竞赛平台、成果对接平台、实践孵化平台”创新创业能力训练体系，依托国家、省、校三级实验教学中心，打造大学生创新创业开放实验平台，激发学生的创新思维；打造“学院、学校、省级、国家、国际”五级竞赛促学平台，鼓励大学生以创新成果主要完成人身份参与各级竞赛，并挖掘可塑性强的项目落地转化；重点建设南京农业大学科技成果对接网站，发起成立“华东农业科技创新联盟”，鼓励学生创新创业项目发挥学科优势、与老师的科研成果转化相结合；三校区结合、校内外结合，建立大学生创客空间和大学生创新创业试验区，打造创业实践孵化平台。
