溴甲烷剧毒。空气中容许浓度 1 ppm。(美国工业卫生学家会议(ACGIH) 1998年环境化学物质阈限值) ,GBZ 2-2002<<工作场所有害因素职业接触限值>>规定溴甲烷(皮)时间加权平均容许浓度2mg/m3。 对人体可引起神经系统障碍、肺水肿、肾闭锁等。
与真菌、细菌、病毒、昆虫等有害生物相比，人可能脆弱。所以，作为一种对这些有害生物所向披靡的杀虫剂，对人的毒害也是显而易见的。它是一种强烈的神经毒剂，可对人的皮肤、肺、肾脏和肝脏造成直接的损伤。中毒严重者可出现心脏衰竭、休克等症状，个别中毒者还会出现双目失明。因此，许多严格规定使用人员经过培训，且要求有相应的安全设备和达到一定的通风时间，以去除残留的溴甲烷。
随着地球日的临近，这种被使用的溴甲烷熏蒸剂引起了性的关注。这种熏蒸剂自20世纪40年代以来就一直被各国使用。由于它具有诸多优点，因而深受人们的喜爱;又因为它引发出了诸多环境和土壤问题，因而备受争议。20世纪90年代起，各国出于安全考虑都趋于停止使用这种薰蒸剂，前段时间也被联合国环境规划署叫停。但是，时至今日，它还是在全范围内普遍使用。
溴甲烷是一种消耗臭氧层的物质，根据《蒙特利尔议定书哥本哈根修正案》，发达于2005年淘汰，发展中也将于2015 年淘汰。
工业产品
溴甲烷工业产品执行：GB435--1995《溴甲烷原药》。
规定的产品质量指标：优等品：
溴甲烷含量：≥99.5%(m/m)
酸度(以HBr计)：≤0.02%(m/m)
不挥发物含量：≤0.03%(m/m)
